作为国家临床重点专科，潍坊眼科医院设有潍坊市眼科研究所、北大医学--正大光明视觉健康联合实验室、山东大学眼科中心分子实验室、山东省眼病筛查中心、潍坊市白内障超声乳化新技术工程实验室、潍坊市分子生物与眼科学分子生物重点实验室、潍坊市医学会儿童青少年近视防控工作办公室等，同时医院也是青岛大学医学部、山东第二医科大学、滨州医学院临床教学基地、研究生培养基地。近年来，发表国内外核心期刊文章80余篇，其中SCI文章78篇，著作16部，申请并授权的发明专利8项，实用新型专利90余项，在2020年度中国医院科技量值（STEM）眼科学科排行榜中位列第29名（山东省内位列三甲），在2023年全国GCP机构药物临床试验量值排行榜眼科专科榜中位列全国第32名（山东省排名第1）。
　　2018年，医院牵头成立潍坊市首个眼科医联体，联合潍坊市及周边地区百余家医疗机构，通过建立远程会诊中心、共享专家、设备、学术交流、学科建设等多种方式，上下联动，互联互通，切实解决百姓看病难问题。二十六年来，潍坊眼科医院在临床诊疗、教学科研、防盲扶贫和人才培养等方面为我国眼科事业的发展做出了重要贡献。凭借精湛的医疗技术，吸引了来自全国各地乃至境外患者。